miércoles, 17 de diciembre de 2014

Programa biolansys

En la sección software del portal biolansys está disponible para descargar el archivo comprimido Biolansys.zip.
Este archivo contiene un programa de bioinformática con las siguientes prestaciones :
  • Alineación de secuencias múltiples utilizando los programas ClustalW2ClustalOMuscleKAlign,Dialign-txPCMAPrankCentroid_alignT_Coffee ,MAFFT
  • Visualización de árboles filogenéticos a partir de alineaciones múltiples utilizando los programasNJPlot , TreeViewX y Archaeopteryx
  • Generación de árboles filogenéticos a partir de alineaciones múltiples mediante PhyML
  • Conversión de formatos de secuencias : local utilizando el programa ReadSeq y web (HIV Databases Home)
  • Editor de secuencias : local y web (www.fr33.net)
  • Generador de proteinas a partir de DNA/RNA : web (www.fr33.net)
  • Predicción de estructura secundaria de RNA mediante Centroid-fold
  • Visualización de estructura secundaria de RNA mediante VARNA y RNAMovies
  • Ejecución de programas externos de terceros :
    • ClustalX (Alineación de múltiples secuencias)
    • ClustalW2 (Alineación de múltiples secuencias)
    • PhyloWin (Arboles filogenéticos)
    • NJPlot (Arboles filogenéticos)
    • Unrooted (Arboles filogenéticos)
    • Treeview (Arboles filogenéticos)
    • Archaeopteryx (Arboles filogenéticos)
    • Readseq (Conversión de Formatos)
    • Jmol (Visualización de moléculas)
  • Acceso a recursos bioinformáticos en la web :
    • Portal EnsEmbl
    • Genbank
    • Genscan
    • DNA Data Bank
    • Protein Data Bank
    • ExPASy