Programa biolansys

En la sección software del portal biolansys está disponible para descargar el archivo comprimido Biolansys.zip.

Este archivo contiene un programa de bioinformática con las siguientes prestaciones :

• Alineación de secuencias múltiples utilizando los programas ClustalW2, ClustalO, Muscle, KAlign,Dialign-tx, PCMA, Prank, Centroid_align, T_Coffee ,MAFFT
• Visualización de árboles filogenéticos a partir de alineaciones múltiples utilizando los programasNJPlot , TreeViewX y Archaeopteryx
• Generación de árboles filogenéticos a partir de alineaciones múltiples mediante PhyML
• Conversión de formatos de secuencias : local utilizando el programa ReadSeq y web (HIV Databases Home)
• Editor de secuencias : local y web (www.fr33.net)
• Generador de proteinas a partir de DNA/RNA : web (www.fr33.net)
• Predicción de estructura secundaria de RNA mediante Centroid-fold
• Visualización de estructura secundaria de RNA mediante VARNA y RNAMovies
• Ejecución de programas externos de terceros :
  • ClustalX (Alineación de múltiples secuencias)
  • ClustalW2 (Alineación de múltiples secuencias)
  • PhyloWin (Arboles filogenéticos)
  • NJPlot (Arboles filogenéticos)
  • Unrooted (Arboles filogenéticos)
  • Treeview (Arboles filogenéticos)
  • Archaeopteryx (Arboles filogenéticos)
  • Readseq (Conversión de Formatos)
  • Jmol (Visualización de moléculas)
• Acceso a recursos bioinformáticos en la web :
• Portal EnsEmbl
• Genbank
• Genscan
• DNA Data Bank
• Protein Data Bank
• ExPASy